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ISO にかかる費用としては、まず審査登録費用があります。その他、専任のスタッフを配置した際の人件費を費用として計上する組織もあります。また、文書を改訂する毎に最新版を必要部数配布することになるため、コピー用紙代なども必要となり、このような負担を軽減するため、システム導入時に LAN などのネットワークを整備し、オンラインで文書・記録を管理する組織も少なくありません。認証取得する際には、文書審査、予備審査（事前調査）、登録審査などの審査を受審するのが一般的なため、初年度はその分費用が多くかかります。認証取得後も半年もしくは 1 年に 1 回の定期審査、 3 年に 1 回の更新審査があります。これらに要する費用は審査登録機関によって大きく異なりますが、審査を受ける病院の職員数に比例して金額も大きくなります。職員が 100 人前後の病院で、 200 〜 300 万円程度かかるのが一般的なようです。その他、コンサルタント会社に依頼すれば別途 300 〜 500 万円程度かかることから、目的を明確にし、慎重に取り組む必要があります。
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